Mas uma coisa é o boardingpass na app, outra é um PDF no telemóvel - versão digital do que seria impresso.
Tal como indicou o roller, fazes o scan como se fosse o boardingpass em papel, apenas terás que fazer o zoom correctamente e aumentar ao máximo a luminosidade do ecrã. De resto é tudo igual!
Esquece a app, faz o check-in e pede o envio do boardingpass por e-mail. Faz a transferência do PDF e guarda no telemóvel.
Desde que o telemóvel funcione e o mostres correctamente, é tão válido como a versão em papel.