Olá,
Partindo do princípio que estarás sem carro e com apenas 1 dia para o Lago Como, sugiro fazer um bate-volta desde Milão:
» Comboio em Milano Centrale para Varenna-Ensino (comboio Trenord de hora em hora, cerca de 7€ para viagem de 1 hora)
» Em Varenna vais até ao terminal de ferry e apanhas um Traghetto para visitar Bellagio, daí Traghetto para visitar Menaggio e daí regresso a Varenna. Existem barcos entre as três e o valor por trajecto é 4,6€ e existe também bilhete livre circulação por 15€. Podes ver no site da navegação nos lagos:
Tickets and timetables Lake Como - Navigazione Laghi
» Sugiro deixar Varenna para no final pois a seguir fazes comboio Varenna-Milão e Milão-Verona Puorta Nova.
Caso fiques vários dias em Milão, o melhor é fazer o passeio a meio da estadia pois assim não existe preocupação com as malas nem tens de pagar cacifo na estação.
Quanto a excursões de 1 dia, é possível encontrar em sites como Get Your Guide e Viator.