Olá João,
Eu já estive nos dois sítios, sempre na cadeia de hotéis Bahia Principe.
Samaná é um local paradisíaco, como diz a Nin, a areia é fina, muito clarinha, a água de um azul turquesa perfeito e bem quentinha e os peixinhos andam mesmo na beirinha da água, ou seja, foi a melhor praia onde estive até hoje. Estive no Hotel BP El Portillo, que é muito bom e não tem (pelo menos na altura) outros Hoteis á volta, o que faz com ainda seja mais paradisíaco
Puerto Plata também é muito bom, mas tem uma diferença de Samaná na praia, também tem água quentinha e de um azul turquesa lindo, a areia é fina, limpa mas de uma cor escura (quase preta), para mim não fez nenhuma diferença, mas acredito que para algumas pessoas estrague um bocado a imagem do "postal perfeito". O Hotel onde estive, BP San Juan também é muito bom e embora tenha 4 estrelas em nada fica atrás dos de 5 estrelas, é um bocado mais antigo, mas compensa noutros pontos e também não tem Hoteis" colado"s a este.
Tanto uma localidade como outra são calminhas, pelo que se a intenção das férias é muita animação e night, então o melhor é escolher Punta Cana.
Quanto a excursões, não posso opinar, pois levei a minha filha que era pequenina e optei por ficar nos Resorts. Também já tinha estado em Punta Cana e já tinha feito a excursão à Ilha Saona (imperdível) e a Santo Domingo (cultural e muito interessante).
Qualquer dúvida é só perguntar